Администрацията на НИО е обща и специализирана.
Дирекциите се ръководят от директори, които се назначават от директора на НИО по реда на Закона за държавния служител.
Общата администрация е организирана в дирекция “Административно осигуряване” (АО), която подпомага осъществяването на правомощията на директора като ръководител на НИО, създава условия за осъществяване на дейността на специализираната администрация и извършва техническите дейности по административното обслужване.
Специализираната администрация е организирана в дирекция “Инспектиране”, която участва в организирането и провеждането на обучението на външните инспектори, в планирането, организирането и осъществяването на инспектиране, формира оценка за силните страни в дейността на детските градини и училищата и определя насоките за подобряване.
Стела Мицова – директор на дирекция „Инспектиране”
Гинка Ефтимова – държавен инспектор в дирекция „Инспектиране”
Румяна Томова – държавен инспектор в дирекция „Инспектиране”
Ваня Янева – главен инспектор в дирекция „Инспектиране”
Моника Николова – главен инспектор в дирекция „Инспектиране”
Радостина Тонева – главен инспектор в дирекция „Инспектиране”
Румяна Белчева – главен инспектор в дирекция „Инспектиране”
Румяна Гьорева – главен инспектор в дирекция „Инспектиране”
Златина Радушева – старши инспектор в дирекция „Инспектиране”
Катя Илиева – старши инспектор в дирекция „Инспектиране”